fastq

2024/7/8 2:34:50

练习--01--对fastq文件进行序列长度统计并绘图

主要实现对fastq文件中不同长度序列进行统计并绘制简单的直方图 详细可见代码说明及注释 #_*_coding:UTF-8_*_ """ 对fastq文件中的序列进行处理 1.获取序列的id和序列信息 2.统计每个id对应的序列的长度 3.对序列长度进行统计 """ import os …

练习_对fastq文件进行读写

练习_对fastq文件进行读写 利用python脚本对fastq文件进行处理 首先读取fastq文件,由于该文件为压缩的二进制文件,调用gzip模块打开其次,根据fastq文件格式特点,对文件进行分离处理,第一行为序列id信息,紧…